未经消毒的生活饮用水中含有致病微生物，主要是指细菌性病源微生物和病毒性原微生物。常见的有:传染性肝炎病毒、眼结膜炎病毒、脑膜炎病毒和大肠杆菌等。消毒就是要求把致病微生物和致病细菌消灭掉。
二氧化氯是一种广谱型的消毒剂，它对水中的病原微生物，包括病毒、芽孢、配水管网中的异养菌、硫酸盐还原菌及真菌等均有很好的杀灭作用。二氧化氯适用的DH值范围很宽，在水中的扩散速度较快,所以在低浓度时较氯更为有效。二氧化氯杀灭病毒的作用比臭氧和氯更有效。二氧化氯对水中脊髓灰质炎病毒、柯萨奇病毒、人类肠道病毒、疱疹病毒、新城病毒噬菌体、牛痘病毒等众多病毒，均有很好的杀灭效果。
